MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfurococcus kamchatkensis 1221n chromosome

Total Repeats: 27750

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011766	GGGA	2	8	55	62	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011766	GAG	2	6	68	73	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011766	GAG	2	6	80	85	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011766	AGG	2	6	91	96	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011766	AGA	2	6	192	197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218883315
6	NC_011766	GCA	2	6	202	207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218883315
7	NC_011766	CTAG	2	8	303	310	25 %	25 %	25 %	25 %	218883316
8	NC_011766	C	6	6	324	329	0 %	0 %	0 %	100 %	218883316
9	NC_011766	GAA	2	6	389	394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218883316
10	NC_011766	ACT	2	6	518	523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218883316
11	NC_011766	ACT	2	6	633	638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218883316
12	NC_011766	TC	3	6	672	677	0 %	50 %	0 %	50 %	218883316
13	NC_011766	TAT	2	6	680	685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218883316
14	NC_011766	CTC	2	6	706	711	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218883316
15	NC_011766	ATT	2	6	759	764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218883316
16	NC_011766	TCC	3	9	785	793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218883316
17	NC_011766	TAT	2	6	794	799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218883316
18	NC_011766	TA	5	10	863	872	50 %	50 %	0 %	0 %	218883316
19	NC_011766	ATCAAC	2	12	875	886	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	218883316
20	NC_011766	CAA	2	6	916	921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218883316
21	NC_011766	CGA	2	6	1084	1089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218883316
22	NC_011766	CTTCT	2	10	1100	1109	0 %	60 %	0 %	40 %	218883316
23	NC_011766	GTATT	2	10	1186	1195	20 %	60 %	20 %	0 %	218883316
24	NC_011766	CTC	2	6	1227	1232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218883316
25	NC_011766	AT	3	6	1375	1380	50 %	50 %	0 %	0 %	218883316
26	NC_011766	ATTA	2	8	1392	1399	50 %	50 %	0 %	0 %	218883316
27	NC_011766	CAC	2	6	1417	1422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218883317
28	NC_011766	TA	3	6	1503	1508	50 %	50 %	0 %	0 %	218883317
29	NC_011766	CAA	2	6	1575	1580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218883317
30	NC_011766	ACC	2	6	1630	1635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218883317
31	NC_011766	CTT	2	6	1648	1653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218883317
32	NC_011766	CTA	2	6	1662	1667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218883317
33	NC_011766	AAT	2	6	1780	1785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011766	C	6	6	1816	1821	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
35	NC_011766	A	6	6	1953	1958	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011766	CTT	2	6	1997	2002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_011766	CTT	2	6	2024	2029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_011766	CTTC	2	8	2032	2039	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_011766	CTT	2	6	2045	2050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_011766	AGT	2	6	2084	2089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011766	TTGT	2	8	2126	2133	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011766	ATT	2	6	2134	2139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011766	AGA	2	6	2222	2227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011766	TGG	2	6	2272	2277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218883318
45	NC_011766	CAT	2	6	2311	2316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218883318
46	NC_011766	AAAGGA	2	12	2317	2328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218883318
47	NC_011766	ATG	2	6	2331	2336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218883318
48	NC_011766	ATA	2	6	2363	2368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218883318
49	NC_011766	ACT	2	6	2386	2391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218883318
50	NC_011766	AAGT	2	8	2412	2419	50 %	25 %	25 %	0 %	218883318
51	NC_011766	AAT	2	6	2435	2440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218883318
52	NC_011766	AAT	2	6	2443	2448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218883318
53	NC_011766	AT	3	6	2447	2452	50 %	50 %	0 %	0 %	218883318
54	NC_011766	AAG	2	6	2459	2464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218883318
55	NC_011766	AAT	2	6	2481	2486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218883319
56	NC_011766	TC	3	6	2488	2493	0 %	50 %	0 %	50 %	218883319
57	NC_011766	GCC	2	6	2542	2547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218883319
58	NC_011766	AAT	2	6	2581	2586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218883319
59	NC_011766	TAT	2	6	2636	2641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218883319
60	NC_011766	CAT	2	6	2687	2692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218883319
61	NC_011766	TA	3	6	2799	2804	50 %	50 %	0 %	0 %	218883319
62	NC_011766	TA	3	6	2832	2837	50 %	50 %	0 %	0 %	218883319
63	NC_011766	CCTCTA	2	12	2846	2857	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	218883319
64	NC_011766	TCT	2	6	2891	2896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218883319
65	NC_011766	TGA	2	6	2901	2906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218883319
66	NC_011766	GTA	2	6	2939	2944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218883319
67	NC_011766	AAT	2	6	2959	2964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218883319
68	NC_011766	TA	3	6	3165	3170	50 %	50 %	0 %	0 %	218883319
69	NC_011766	CCA	2	6	3223	3228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218883319
70	NC_011766	GATT	2	8	3273	3280	25 %	50 %	25 %	0 %	218883319
71	NC_011766	TAAT	2	8	3341	3348	50 %	50 %	0 %	0 %	218883319
72	NC_011766	TTC	2	6	3393	3398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218883319
73	NC_011766	AT	3	6	3415	3420	50 %	50 %	0 %	0 %	218883319
74	NC_011766	T	6	6	3420	3425	0 %	100 %	0 %	0 %	218883319
75	NC_011766	TGGT	2	8	3428	3435	0 %	50 %	50 %	0 %	218883319
76	NC_011766	C	7	7	3478	3484	0 %	0 %	0 %	100 %	218883320
77	NC_011766	TGAG	2	8	3580	3587	25 %	25 %	50 %	0 %	218883320
78	NC_011766	CTTC	2	8	3592	3599	0 %	50 %	0 %	50 %	218883320
79	NC_011766	TAC	2	6	3712	3717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218883320
80	NC_011766	TCG	2	6	3729	3734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218883320
81	NC_011766	TA	4	8	3805	3812	50 %	50 %	0 %	0 %	218883320
82	NC_011766	CTA	2	6	3855	3860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218883320
83	NC_011766	AAT	2	6	3878	3883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218883320
84	NC_011766	CATTAC	2	12	3907	3918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218883320
85	NC_011766	TCG	2	6	3937	3942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218883320
86	NC_011766	CCCCT	2	10	3951	3960	0 %	20 %	0 %	80 %	218883320
87	NC_011766	CT	3	6	4048	4053	0 %	50 %	0 %	50 %	218883320
88	NC_011766	TAT	2	6	4054	4059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218883320
89	NC_011766	ACCAT	2	10	4137	4146	40 %	20 %	0 %	40 %	218883320
90	NC_011766	GC	3	6	4174	4179	0 %	0 %	50 %	50 %	218883320
91	NC_011766	TG	3	6	4229	4234	0 %	50 %	50 %	0 %	218883320
92	NC_011766	GAA	2	6	4265	4270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218883320
93	NC_011766	GGGTA	2	10	4284	4293	20 %	20 %	60 %	0 %	218883320
94	NC_011766	ATG	2	6	4343	4348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218883320
95	NC_011766	CCT	2	6	4429	4434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218883320
96	NC_011766	ATT	2	6	4446	4451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218883320
97	NC_011766	CTT	2	6	4460	4465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218883320
98	NC_011766	TA	3	6	4486	4491	50 %	50 %	0 %	0 %	218883320
99	NC_011766	CCAG	2	8	4521	4528	25 %	0 %	25 %	50 %	218883320
100	NC_011766	AT	3	6	4565	4570	50 %	50 %	0 %	0 %	218883320
101	NC_011766	GCT	2	6	4617	4622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218883320
102	NC_011766	T	6	6	4751	4756	0 %	100 %	0 %	0 %	218883320
103	NC_011766	TAC	2	6	4876	4881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218883320
104	NC_011766	TCCC	2	8	4901	4908	0 %	25 %	0 %	75 %	218883321
105	NC_011766	GAT	2	6	4973	4978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218883321
106	NC_011766	TAG	2	6	4997	5002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218883321
107	NC_011766	CCT	2	6	5050	5055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218883321
108	NC_011766	ATT	2	6	5070	5075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218883321
109	NC_011766	TCG	2	6	5109	5114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218883321
110	NC_011766	CTT	2	6	5160	5165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218883321
111	NC_011766	TC	3	6	5168	5173	0 %	50 %	0 %	50 %	218883321
112	NC_011766	CCA	2	6	5175	5180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218883321
113	NC_011766	CTC	2	6	5213	5218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218883321
114	NC_011766	TTA	2	6	5320	5325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218883321
115	NC_011766	CT	3	6	5392	5397	0 %	50 %	0 %	50 %	218883321
116	NC_011766	GT	3	6	5399	5404	0 %	50 %	50 %	0 %	218883321
117	NC_011766	GGAT	2	8	5462	5469	25 %	25 %	50 %	0 %	218883321
118	NC_011766	TTA	2	6	5630	5635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011766	TAA	2	6	5681	5686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011766	TTA	2	6	5702	5707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011766	ATCAT	2	10	5755	5764	40 %	40 %	0 %	20 %	218883322
122	NC_011766	GAA	2	6	5784	5789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218883322
123	NC_011766	AGG	2	6	5817	5822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218883322
124	NC_011766	CGT	2	6	5928	5933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218883322
125	NC_011766	GAA	2	6	6000	6005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218883322
126	NC_011766	ACC	2	6	6009	6014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218883322
127	NC_011766	TGGCT	2	10	6052	6061	0 %	40 %	40 %	20 %	218883322
128	NC_011766	CAG	2	6	6070	6075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218883322
129	NC_011766	TA	3	6	6080	6085	50 %	50 %	0 %	0 %	218883322
130	NC_011766	GAA	2	6	6099	6104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218883322
131	NC_011766	CA	3	6	6144	6149	50 %	0 %	0 %	50 %	218883322
132	NC_011766	CAA	2	6	6188	6193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218883322
133	NC_011766	AGG	2	6	6218	6223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218883322
134	NC_011766	GA	3	6	6240	6245	50 %	0 %	50 %	0 %	218883322
135	NC_011766	AGG	2	6	6286	6291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218883322
136	NC_011766	TTA	2	6	6418	6423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218883322
137	NC_011766	GATA	2	8	6441	6448	50 %	25 %	25 %	0 %	218883322
138	NC_011766	GA	3	6	6463	6468	50 %	0 %	50 %	0 %	218883322
139	NC_011766	AT	3	6	6491	6496	50 %	50 %	0 %	0 %	218883322
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273	NC_011766	AT	3	6	12647	12652	50 %	50 %	0 %	0 %	218883329
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